1 R Management

1.1 R基本操作

Alt + Shift + K	显示Rstudio所有快捷命令
Alt + -	输入等于号 <-
Ctrl + Shift + M	输入通道符 %>%
占位符 .	mtcars %>% select(cyl) %>% colMeans() %>% rep(1,.)
help(package=“graphics”)	查看某个package的帮助文档
?mean	查看某个函数的帮助文档
update.packages()	更新所有package
remove.packages(“openxlsx”)	删除某个package
methods(plot)	查看某个系列（子函数）的函数的使用场景
traceback() browser() debugone()/debug()	debug函数
rm(list = ls())	清空当前环境
setwd(dir = “D:/XXXX/XX”)	设置目录，需要注意R中目录路径需要使用正斜线/,而不是反斜线
getwd()	查看当前工作目录路径GitHub代码托管

已安装Git软件（可参考手把手教你用git上传项目到GitHub），在需要托管的本地代码的目录右键单击 Open Git Bash here，并将该目录变成Git可以管理的仓库。

git init

目录下会出现.git（隐藏）文件夹，然后将所有文件添加到仓库。

git add .

然后将文件提交至仓库，并填写注释。

git commit -m "comments"

复制GitHub上SSH公钥，与之进行链接。

git remote add origin git@github.com:AQ-Life/R-Programming.git

上传本地代码。

git push -u origin master

对更新的book或website进行publish（发布）操作，在R studio Terminal窗口：

quarto publish gh-pages

R Package开发参考R文档操作指南：

File –> New Project –> New Directory –> R Package –> type Package name –> select project root path – > Create Project

xxx <- function(xx1, xx2){
  ...
}

选中函数名（xxx），Ctrl+Shift+Alt+R 快捷键添加自定义函数的头部注释，如下：

#' Title
#'
#' @param xx1
#' @param xx2
#'
#' @return
#' @export
#'
#' @examples
xxx <- function(xx1, xx2){
  ...
}

library(devtools)

devtools::document()
devtools::load_all()

myfunction1(xx1)
myfunction2(xx2)

devtools::build()
devtools::check()

use_readme_rmd() #创建.rmd文档
build_readme() #文档创建之后创建.md文档